Een Doorbraak-project omvat drie werkconferenties: een start-, een midden- en een eindconferentie (zie schema).

AP = actieperiode
Na elke werkconferentie volgt een actieperiode van enkele maanden (de duur van deze periode is mede afhankelijk van de voortgang). Maximaal duurt een Doorbraak-project een jaar. Een Doorbraak-project wordt doorgaans afgesloten met een slotmanifestatie, die door de organisatie(s) zelf wordt georganiseerd. Tijdens deze manifestatie worden alle resultaten en ervaringen uit het Doorbraakproject aan belangstellenden gepresenteerd.